MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sinorhizobium fredii USDA 257 plasmid pUSDA257

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018194	CGGC	2	8	49	56	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_018194	CGGT	2	8	105	112	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018194	CG	3	6	124	129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018194	TTCG	2	8	169	176	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018194	A	6	6	207	212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018194	GAA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018194	GCC	2	6	421	426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018194	GAT	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018194	GAA	2	6	476	481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018194	GCC	2	6	618	623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_018194	GCA	2	6	700	705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018194	GCGG	2	8	738	745	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018194	AT	3	6	758	763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018194	T	6	6	770	775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018194	CTC	2	6	825	830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018194	AG	3	6	879	884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018194	AG	3	6	927	932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018194	AGT	2	6	944	949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018194	A	6	6	984	989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018194	GCGA	2	8	1045	1052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018194	GCCT	2	8	1138	1145	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018194	ATTG	2	8	1947	1954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018194	GCC	2	6	2025	2030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_018194	CCA	2	6	2054	2059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018194	CA	3	6	3821	3826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018194	ACA	3	9	3824	3832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018194	AGCAT	2	10	3886	3895	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018194	TC	3	6	4169	4174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018194	CGC	2	6	4269	4274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_018194	GAA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018194	AAG	2	6	4293	4298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018194	GC	3	6	4324	4329	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018194	GCA	2	6	4405	4410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018194	A	6	6	4427	4432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018194	ATC	2	6	4546	4551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018194	GGCAA	2	10	4591	4600	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_018194	ACGG	2	8	4606	4613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018194	CAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018194	GCTG	2	8	4677	4684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_018194	GCGA	2	8	4767	4774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018194	TTG	2	6	4817	4822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018194	GCC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_018194	CCA	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018194	TTC	2	6	4960	4965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018194	CCG	2	6	5024	5029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_018194	CAG	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018194	CCGT	2	8	7480	7487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_018194	AGC	2	6	8522	8527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018194	CGT	2	6	8539	8544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018194	CGGT	2	8	8620	8627	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018194	GAA	2	6	8642	8647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018194	TGC	2	6	8743	8748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018194	GTC	2	6	8806	8811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018194	GTTG	2	8	8832	8839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018194	AGTG	2	8	8853	8860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018194	AC	3	6	8909	8914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018194	TTC	2	6	8920	8925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018194	TCT	2	6	8937	8942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_018194	ATTG	2	8	8968	8975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018194	TGA	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018194	CGG	2	6	9059	9064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018194	GCCA	2	8	9079	9086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.